Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms