Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek3Q9R0A5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms