Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmfrQ9R049 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AmfrQ9R049 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms