Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms