Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a4Q9QZR9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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