Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms