Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms