Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms