Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnnt3Q9QZ47 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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