Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Six6Q9QZ28 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Six6Q9QZ28 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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