Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Exo1Q9QZ11 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exo1Q9QZ11 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exo1Q9QZ11 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exo1Q9QZ11 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exo1Q9QZ11 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exo1Q9QZ11 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Exo1Q9QZ11 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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