Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snai3Q9QY31 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms