Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ehd3Q9QXY6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms