Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Kcnip3Q9QXT8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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