Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Copg2Q9QXK3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms