Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms