Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Limd1Q9QXD8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms