Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sall2Q9QX96 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall2Q9QX96 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms