Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cln8Q9QUK3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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