Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hdgfl3Q9JMG7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hdgfl3Q9JMG7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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