Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc2lQ9JME7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms