Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst11Q9JME2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst11Q9JME2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms