Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Prg4Q9JM99 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg4Q9JM99 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prg4Q9JM99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prg4Q9JM99 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Prg4Q9JM99 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prg4Q9JM99 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prg4Q9JM99 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Prg4Q9JM99 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prg4Q9JM99 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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