Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms