Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd2apQ9JLQ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms