Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dclk1Q9JLM8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclk1Q9JLM8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms