Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gde1Q9JL56 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms