Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmgn5Q9JL35 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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