Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bace2Q9JL18 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bace2Q9JL18 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms