Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp4Q9JKV5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms