Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL1

Prokr1, Prokineticin receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prokr1Q9JKL1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prokr1Q9JKL1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms