Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms