Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms