Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddx20Q9JJY4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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