Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms