Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EefsecQ9JHW4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms