Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcirg1Q9JHF5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms