Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn19Q9ET38 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn19Q9ET38 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn19Q9ET38 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn19Q9ET38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn19Q9ET38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn19Q9ET38 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn19Q9ET38 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn19Q9ET38 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn19Q9ET38 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn19Q9ET38 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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