Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim39Q9ESN2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim39Q9ESN2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms