Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim54Q9ERP3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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