Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc28a3Q9ERH8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms