Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb3Q9ERD7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms