Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn12Q9ER56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms