Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms