Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcr6Q9EQ16 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms