Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SgshQ9EQ08 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms