Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xab2Q9DCD2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms