Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubiad1Q9DC60 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms