Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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