Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms